Le coût des intérêts notionnels

D'une part on parle de environ 2,5 milliards d'euros et puis d'environ 400 millions...

Les économistes ont-ils tellement de difficulté avec les calculs?

Non.
Tout simplement l'ordre de grandeur de 2,5 milliards est le coût brut (donc ce que les entreprises économiseront comme impôts) et le 400 millions, le coûts net, déduction faite des investissements, des emplois créés, et ainsi de suite.

Parler d'un chiffre sans préciser la notion n'est pas très honnête.